Para la dirección y funcionamiento de la Fuerza Aérea se establece la siguiente estructura:

1. Jefe de Estado Mayor, en su calidad de Comandante, con sus asesores generales:
1. Subjefe de Estado Mayor,
2. Inspector General,
3. Comandante de Base.
2. Estado Mayor Coordinador,
3. Estado Mayor Especial,
4. Comandos,
5. Estado Mayor Personal.

Estado Mayor Coordinador
El Estado Mayor Coordinador de la Fuerza Aérea Dominicana, es un organismo de planificación, consulta y asesoramiento, que tiene por objeto la elaboración de planes, programas, formulación de políticas y directrices que sirven de base en la toma de decisiones para el desarrollo, equipamiento, entrenamiento y empleo de los recursos de la Fuerza Aérea Dominicana.

El Estado Mayor Coordinador de la Fuerza Aérea Dominicana está presidido por el Jefe de Estado Mayor y será convocado por el Subjefe de Estado Mayor; estará integrado de la siguiente manera:

1. Jefe de Estado Mayor,
2. Sub-Jefe de Estado Mayor,
3. Inspector General,
4. Comandante de la Base,
5. Director de Personal,
6. Director de Inteligencia,
7. Director de Operaciones,
8. Director de Logística,
9. Director de Relaciones Públicas,
10. Director de Comunicaciones y
11. Consultor Jurídico, en su calidad de Secretario, con voz pero sin voto.

Estado Mayor Especial
El Estado Mayor Especial de la Fuerza Aérea Dominicana, es un órgano asesor del Jefe de Estado Mayor y del Alto Mando de la FAD, en materia específica sobre: entrenamiento, armamento, transportación, energía, informática, asuntos jurídicos, financieros y salud.

El Estado Mayor Especial estará estructurado de acuerdo a como lo determine el Señor Jefe de Estado Mayor, para el mejor cumplimiento de las misiones asignadas.

Comandos
Está integrado por las organizaciones que tienen por objeto organizar y entrenar el personal para el cumplimiento de las misiones asignadas a la Fuerza Aérea Dominicana.

Los Comandos están integrados por Escuadrones, los cuales son las unidades básicas funcionales para la ejecución de las misiones.

Estado Mayor Personal
Estará conformado por oficiales encargados de los asuntos relacionados de manera personal con la figura del Jefe de Estado Mayor, y estará compuesto por la cantidad de oficiales que el Jefe de Estado Mayor considere conveniente.

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